only keep REL ions

src/cli/chem-comp-dict/create-ions.ts

@@ -21,7 +21,8 @@ function extractIonNames(ccd: DatabaseCollection<CCD_Schema>) {
     const ionNames: string[] = [];
     for (const k in ccd) {
         const {chem_comp} = ccd[k];
-        if (chem_comp.name.value(0).toUpperCase().includes(' ION')) {
+        if ((chem_comp.name.value(0).toUpperCase().includes(' ION')) &&
+            (chem_comp.pdbx_release_status.value(0) === 'REL')) {
             ionNames.push(chem_comp.id.value(0));
         }
     }

src/mol-model/structure/model/types/ions.ts

@@ -6,4 +6,4 @@
 * @author molstar/chem-comp-dict/create-table cli
 */
 
-export const IonNames = new Set(['118', '119', '543', '1AL', '1CU', '2FK', '2HP', '2OF', '3CO', '3MT', '3NI', '3OF', '3P8', '4MO', '4PU', '4TI', '6MO', 'ACT', 'AG', 'AL', 'ALF', 'AM', 'ATH', 'AU', 'AU3', 'AUC', 'AZI', 'BA', 'BCT', 'BEF', 'BF4', 'BO4', 'BR', 'BS3', 'BSY', 'CA', 'CAC', 'CD', 'CD1', 'CD3', 'CD5', 'CE', 'CF', 'CHT', 'CL', 'CO', 'CO3', 'CO5', 'CON', 'CR', 'CS', 'CSB', 'CU', 'CU1', 'CU3', 'CUA', 'CUZ', 'CYN', 'DME', 'DMI', 'DSC', 'DTI', 'DY', 'E4N', 'EDR', 'EMC', 'ER3', 'EU', 'EU3', 'F', 'FE', 'FE2', 'FPO', 'GA', 'GD3', 'GEP', 'HAI', 'HG', 'HGC', 'IN', 'IOD', 'IR', 'IR3', 'IRI', 'IUM', 'K', 'KO4', 'LA', 'LCO', 'LCP', 'LI', 'LU', 'MAC', 'MG', 'MH2', 'MH3', 'MLI', 'MMC', 'MN', 'MN3', 'MN5', 'MN6', 'MO1', 'MO2', 'MO3', 'MO4', 'MO5', 'MO6', 'MOO', 'MOS', 'MOW', 'MW1', 'MW2', 'MW3', 'NA', 'NA2', 'NA5', 'NA6', 'NAO', 'NAW', 'NET', 'NH4', 'NI', 'NI1', 'NI2', 'NI3', 'NO2', 'NO3', 'NRU', 'O4M', 'OAA', 'OC1', 'OC2', 'OC3', 'OC4', 'OC5', 'OC6', 'OC7', 'OC8', 'OCL', 'OCM', 'OCN', 'OCO', 'OF1', 'OF2', 'OF3', 'OH', 'OS', 'OS4', 'OXL', 'PB', 'PBM', 'PD', 'PDV', 'PER', 'PI', 'PO3', 'PO4', 'PR', 'PT', 'PT4', 'PTN', 'RB', 'RH3', 'RHD', 'RU', 'SB', 'SCN', 'SE4', 'SEK', 'SM', 'SMO', 'SO3', 'SO4', 'SR', 'T1A', 'TB', 'TBA', 'TCN', 'TEA', 'TH', 'THE', 'TL', 'TMA', 'TRA', 'UNX', 'V', 'VN3', 'VO4', 'W', 'WO5', 'Y1', 'YB', 'YB2', 'YH', 'YT3', 'ZCM', 'ZN', 'ZN2', 'ZN3', 'ZNO', 'ZO3', 'ZR', 'NCO', 'OHX']);
+export const IonNames = new Set(['118', '1AL', '2FK', '2HP', '3CO', '3MT', '3NI', '3P8', '4MO', '4PU', '4TI', '6MO', 'ACT', 'AG', 'AL', 'ALF', 'AM', 'ATH', 'AU', 'AU3', 'AUC', 'AZI', 'BA', 'BCT', 'BEF', 'BF4', 'BO4', 'BR', 'BS3', 'BSY', 'CA', 'CAC', 'CD', 'CE', 'CF', 'CHT', 'CL', 'CO', 'CO3', 'CON', 'CR', 'CS', 'CSB', 'CU', 'CU1', 'CU3', 'CUA', 'CUZ', 'CYN', 'DME', 'DMI', 'DSC', 'DTI', 'DY', 'EDR', 'EMC', 'ER3', 'EU', 'EU3', 'F', 'FE', 'FE2', 'FPO', 'GA', 'GD3', 'GEP', 'HAI', 'HG', 'IN', 'IOD', 'IR', 'IR3', 'IRI', 'IUM', 'K', 'LA', 'LCO', 'LCP', 'LI', 'LU', 'MAC', 'MG', 'MH2', 'MLI', 'MMC', 'MN', 'MN3', 'MOO', 'MOS', 'MOW', 'NA', 'NET', 'NH4', 'NI', 'NO2', 'NO3', 'NRU', 'OAA', 'OH', 'OS', 'OS4', 'OXL', 'PB', 'PBM', 'PD', 'PDV', 'PER', 'PI', 'PO3', 'PO4', 'PR', 'PT', 'PT4', 'PTN', 'RB', 'RH3', 'RHD', 'RU', 'SB', 'SCN', 'SE4', 'SEK', 'SM', 'SMO', 'SO3', 'SO4', 'SR', 'T1A', 'TB', 'TBA', 'TCN', 'TEA', 'TH', 'THE', 'TL', 'TMA', 'TRA', 'UNX', 'V', 'VN3', 'VO4', 'W', 'WO5', 'Y1', 'YB', 'YB2', 'YT3', 'ZCM', 'ZN', 'ZR', 'NCO', 'OHX']);